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Protocolo de Ligación del Producto de PCR en el pET SUMO y Transformación Bacteriana, Guías, Proyectos, Investigaciones de Inmunología

metodologia, resultados, conclusión

Tipo: Guías, Proyectos, Investigaciones

2021/2022

Subido el 06/12/2023

velasco-hernandez-valeria
velasco-hernandez-valeria 🇲🇽

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Ligación del producto de PCR en el pET SUMO.
Para eficiencias óptimas de ligadura, es recomendable usar productos de PCR
frescos (de menos de 1 día).
Cantidad de producto de PCR a utilizar
Una relación molar de 1:1 de vector: inserto produce la mejor eficiencia de
ligadura.
0.5 a 1.0 μl de una muestra de PCR típica con longitud de inserción promedio de
400-700 pb dará la mejor proporción molar adecuada de 1:1 de vector inserto.
Si requiere mayor precisión en la exactitud de las concentraciones de ADN se
puede realizar una segunda reacción de ligadura usando una proporción molar de
1:3 de vector: inserto.
*No se recomienda utilizar más de 2-3 μl de la muestra de PCR en la reacción de
ligadura, ya que las sales de la muestra de PCR pueden inhibir la T4 ADN
Ligasa. *
Materiales necesarios:
Producto PCR (La descripción para su obtención en la página anterior)
Tampón de ligadura 10X (10X Ligation Buffer, incluido en el kit).
Vector pET SUMO (incluido en el kit).
Agua esterilizada (incluido en el kit).
ADN ligasa T4 (T4 DNA Ligase, incluida en el kit).
Procedimiento para la reacción de ligadura
1. Determinar el volumen de muestra de PCR necesario para alcanzar la
cantidad requerida del producto PCR.
Usar agua esterilizada para diluir la muestra de PCR si es necesario. 2.
Configurar la reacción de ligadura de 10 μl como se indica a continuación:
Producto de PCR fresco ………………………………… X μl
Tampón de ligadura 10X ………………………………...1 μl
Vector pET SUMO (25 ng/μl) …………………………… 2 μl
Agua estéril hasta un volumen total de ………………. 9 μl
ADN ligasa T4 (4.0 unidades Weiss) …………………. 1 μl
Se tiene un volumen final de 10 μl
3. Incubar la reacción de ligadura a 15 °C durante un mínimo de 4 horas
(preferiblemente durante la noche). También se puede incubar la reacción
de ligadura a temperatura ambiente durante 30 minutos.
Se puede almacenar la reacción de ligadura a -20 °C hasta que esté listo para
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¡Descarga Protocolo de Ligación del Producto de PCR en el pET SUMO y Transformación Bacteriana y más Guías, Proyectos, Investigaciones en PDF de Inmunología solo en Docsity!

Ligación del producto de PCR en el pET SUMO.

Para eficiencias óptimas de ligadura, es recomendable usar productos de PCR frescos (de menos de 1 día). Cantidad de producto de PCR a utilizar Una relación molar de 1:1 de vector: inserto produce la mejor eficiencia de ligadura. 0.5 a 1.0 μl de una muestra de PCR típica con longitud de inserción promedio de 400-700 pb dará la mejor proporción molar adecuada de 1:1 de vector inserto. Si requiere mayor precisión en la exactitud de las concentraciones de ADN se puede realizar una segunda reacción de ligadura usando una proporción molar de 1:3 de vector: inserto. *No se recomienda utilizar más de 2-3 μl de la muestra de PCR en la reacción de ligadura, ya que las sales de la muestra de PCR pueden inhibir la T4 ADN Ligasa. * Materiales necesarios: ➢ Producto PCR (La descripción para su obtención en la página anterior) ➢ Tampón de ligadura 10X (10X Ligation Buffer, incluido en el kit). ➢ Vector pET SUMO (incluido en el kit). ➢ Agua esterilizada (incluido en el kit). ➢ ADN ligasa T4 (T4 DNA Ligase, incluida en el kit). Procedimiento para la reacción de ligadura

  1. Determinar el volumen de muestra de PCR necesario para alcanzar la cantidad requerida del producto PCR. Usar agua esterilizada para diluir la muestra de PCR si es necesario. 2. Configurar la reacción de ligadura de 10 μl como se indica a continuación: Producto de PCR fresco ………………………………… X μl Tampón de ligadura 10X ………………………………...1 μl Vector pET SUMO (25 ng/μl) …………………………… 2 μl Agua estéril hasta un volumen total de ………………. 9 μl ADN ligasa T4 (4.0 unidades Weiss) …………………. 1 μl Se tiene un volumen final de 10 μl
  2. Incubar la reacción de ligadura a 15 °C durante un mínimo de 4 horas (preferiblemente durante la noche). También se puede incubar la reacción de ligadura a temperatura ambiente durante 30 minutos. Se puede almacenar la reacción de ligadura a -20 °C hasta que esté listo para

transformación.

Transformación de una bacteria con su producto de ligación.

Una vez que haya ligado su inserto en pET SUMO, transformará su construcción en E. coli competente. One Shot® Mach1™-T1R químicamente competente. Recomendamos utilizar la E. coli químicamente competente One Shot® Mach1™- T1R suministrada en el kit para sus reacciones de transformación. El uso de otras cepas de E. coli puede dar lugar a niveles de fondo más altos. Materiales necesarios:

➢ Reacción de ligación (Este paso se encuentra en la página anterior)

➢ One Shot® Mach1™-T1R químicamente competente E. coli (Caja 2,

incluida en el kit; un vial por transformación)

➢ Medio S.O.C. (Caja 2, incluida en el kit)

➢ Placas LB con 50 g/ml de kanamicina

➢ Baño de agua a 42°C

➢ Incubadora con y sin agitación a 37°C

Procedimiento para la preparación de la transformación:

  • Para cada transformación, necesitará un vial de células competentes y dos placas selectivas. *
  1. Equilibrar un baño de agua a 42°C.
  2. Caliente el vial de medio S.O.C. de la caja 2 a temperatura ambiente.
  3. Caliente las placas LB con 50 g/ml de kanamicina a 37°C durante 30 minutos.
  4. Descongele en hielo 1 vial de células One Shot® para cada transformación. Protocolo para la transformación:
  5. Pipetear 2 l de la reacción de ligación directamente en un vial de One Shot® Chemically Competent E. coli y mezclar suavemente. No mezcle pipeteando hacia arriba y hacia abajo.
  6. Incubar en hielo de 5 a 30 minutos. Nota: Las incubaciones más largas en hielo no parecen afectar a la eficacia de la transformación. La duración de la incubación queda a discreción del usuario.
  7. Caliente las células durante 30 segundos a 42°C sin agitarlas.
  8. Transfiera inmediatamente los tubos a hielo.
  9. Añadir 250 l de medio S.O.C. a temperatura ambiente.
  10. Tapar bien el tubo y agitar horizontalmente (200 rpm) a 37°C durante 1 hora.
  1. Incubar la reacción durante 10 minutos a 94°C para lisar las células e inactivar las nucleasas.
    1. Amplifique durante 20 a 30 ciclos.
    2. Para la extensión final, incubar a 72°C durante 10 minutos. Almacenar a +4°C.
  2. Visualizar mediante electroforesis en gel de agarosa. Almacenamiento a largo plazo Una vez que haya identificado el clon correcto, asegúrese de purificar la colonia y hacer una reserva de glicerol para su almacenamiento a largo plazo. Le recomendamos que almacene una reserva de ADN plasmídico a -20 °C.
  3. Se hace un "streak" de la colonia original para obtener una sola colonia en placas LB con 50 μg /ml de kanamicina.
  4. Aislar una sola colonia e inocularla en 1-2 ml de LB con 50 μg /ml de kanamicina.
  5. Crecer hasta que el cultivo alcance la fase estacionaria.
  6. Mezclar 0,85 ml de cultivo con 0,15 ml de glicerol estéril y transferir a un criovial. 5. Almacenar a -80°C.